W renomowanym czasopiśmie „Nature” 30 marca br. ukazała się praca rzucająca światło na najwcześniejsze, molekularne etapy procesu widzenia u ssaków. Wśród autorów artykułu jest dr Przemysław Nogły, obecnie związany z Centrum Dioscuri Dynamiki Strukturalnej Receptorów na WBBiB. Opublikowane wyniki są zwieńczeniem wieloletnich badań prowadzonych przez naukowców z Instytutu Paula Scherrera w Szwajcarii.

Artykuł pt. Ultrafast structural changes direct the first molecular events of vision poświęcony jest zmianom strukturalnym zachodzącym w cząsteczce rodopsyny na skutek absorpcji światła przez 11-cis-retinal – ligand kowalencyjnie związany z białkiem.  

Dzięki wykorzystaniu czasowo-rozdzielczej seryjnej femtosekundowej krystalografii, w której źródłem promieniowania rentgenowskiego były lasery na swobodnych elektronach naukowcom udało się uzyskać informacje o strukturach, jakie rodopsyna przyjmuje w temperaturze pokojowej w czasie 1 pikosekundy oraz 100 pikosekund po fotoaktywacji.  

Okazało się, że na skutek izomeryzacji retinolu dochodzi do osłabienia wielu oddziaływań van der Waalsa pomiędzy ligandem a aminokwasami z kieszeni wiążącej, a receptor w wyniku relaksacji przyjmuje konformację, która w późniejszych etapach umożliwia oddziaływanie z białkami G i dalszy przekaz sygnału.  

Uzyskane wyniki kładą eksperymentalne podstawy do badania zdarzeń wczesnej aktywacji w dużej rodzinie białek GPCR klasy A. 

Z treścią artykułu oraz krótką wizualizacją przedstawiającym omawiane zmiany można się zapoznać na stronie czasopisma.

Na zakończenie warto wspomnieć, że w gronie autorów artykułu jest także Filip Pamuła, absolwent biochemii, który swoje pierwsze doświadczenia w pracy z receptorami GPCR zdobywał jako magistrant w Zakładzie Biochemii Fizycznej WBBiB pod kierunkiem dr hab. Agnieszki Polit.