Konkurs na stanowiska stypendysty w Zakładzie Biotechnologii Roślin w ramach realizacji projektu badawczego finansowanego z środków programu OPUS24 NCN pt. „Struktura i biosynteza hemiceluloz pierwotnej ściany komórkowej drzew i ich znaczenie w mechanice komórki roślinnej”. Termin nadsyłania zgłoszeń upływa 24 listopada 2023 r.

Stanowisko: stypendysta
Liczba stypendiów: 1
Miejsce realizacji projektu: Zakład Biotechnologii Roślin, Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii, Uniwersytet Jagielloński
Kierownik projektu: dr Jan Łyczakowski
Źródło finansowania: Narodowe Centrum Nauki, program OPUS24
Termin przyjmowania zgłoszeń: 24 listopada 2023, godz. 15:00
Wynagrodzenie: 5 000 PLN/m-c
Data rozpoczęcia: grudzień 2023

Opis projektu
Podstawowe organy roślinne, takie jak liście i kwiaty, cechują się mnogością kształtów i rozmiarów. To przepiękne bogactwo ma znaczenie biologiczne w różnych procesach, takich jak przyciąganie zapylaczy, zwiększanie wydajności fotosyntezy, czy nawet łapanie ofiar przez rośliny mięsożerne. Liście drzew, które są jednymi z ich najważniejszych organów, cechują się dużą różnorodnością wyglądu i kształtu. Kształt liści jest jedną z kluczowych cech umożliwiających identyfikację gatunków drzew. Mimo to, mechanizm umożliwiający drzewom tworzenie liści o tak różnorodnych kształtach nie jest znany. Społeczność naukowa zgadza się, że pierwotne ściany komórkowe (PŚK) są strukturą komórkową, która wpływa na rozwój organów roślinnych. PŚK otacza każdą komórkę roślinną i umożliwia zachowanie jej kształtu i rozmiaru. Wzrost komórki roślinnej jest możliwy tylko poprzez ekspansję PŚK, której towarzyszą zmiany jej właściwości mechanicznych. Niewyjaśnione pozostaje jednak, co kontroluje właściwości PŚK. Struktura ta, na poziomie chemicznym, składa się z wielocukrów. Te długie łańcuchy cukrowe tworzą cząsteczki takie jak celuloza lub pektyny, które przez wiele lat badano pod kątem ich znaczenia w określaniu właściwości mechanicznych PŚK. W niedawno opublikowanej pracy naukowej, której współautorem jest kierownik tego projektu, odkryliśmy, że inna klasa wielocukrów, określana jako hemicelulozy, również wpływa na wzrost PŚK. To ciekawe odkrycie, dokonane w małej roślinie modelowej Arabidopsis thaliana, jest dla nas punktem wyjścia do analizy roli hemiceluloz w innych grupach roślin o większym znaczeniu ekologicznym i ekonomicznym. Dlatego właśnie zdecydowaliśmy się rozpocząć badania nad znaczeniem hemiceluloz dla wzrostu komórek drzew oraz dla ich kształtu i właściwości mechanicznych. Celem naszego projektu jest przedstawienie pierwszego całościowego opisu roli hemiceluloz w rozwoju komórek i organów drzew.

Wymagania
Niezbędne jest spełnianie wymogów formalnych przewidzianych w regulaminie przyznawania stypendiów naukowych w projektach badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki. W szczególnosci, niezbędne jest aby stypendysta/stypendystka spełniał jedno z poniższych kryteriów:
a) był studentem studiów: pierwszego stopnia, drugiego stopnia lub jednolitych studiów magisterskich, realizowanych w uczelniach na terytorium Polski;
b) był uczestnikiem studiów doktoranckich;
c) był doktorantem w szkole doktorskiej.

Dla stypendysty dodatkowe wymagania w związku z realizacją zadań badawczych to:

• Podstawowa wiedza z zakresu biologii i biochemii polisacharydów.
• Doświadczenie w technikach biologii molekularnej takich jak izolacja DNA, klonowanie i transformacja bakterii.
• Doświadczenie w izolacji RNA i DNA z materiału roślinnego.
• Doświadczenie w identyfikacji genów drzew z wykorzystaniem technik filogenetyki molekularnej.
• Doświadczenie w zastosowaniu techniki RT-qPCR do ilościowego określania ekspresji genów drzew.
• Dobra znajomość zasad bezpiecznej i dokładnej pracy laboratoryjnej i zarządzania danymi badawczymi.
• Bardzo dobra znajomość języka angielskiego w mowie i piśmie.

Opis zadań
Osoba wybrana na stanowisko stypendysty bedzie odpowiedzialna za realizacje nastepujacych zadań:
Do zadań stypendystki lub stypendysty będzie należało:

• przygotowanie materiału roślinnego do badań;
• przygotowanie i analiza preparatów ściany komórkowej;
• identyfikacja genów odpowiedzialnych za syntezę pierwotnej ściany komórkowej drzew;
• przygotowanie konstruktów do transformacji genetycznej roślin z wykorzystaniem techniki GoldenGate;
• wyprowadzanie transgenicznych linii roślinnych.

Procedura rekrutacyjna
Zgłoszenia/zapytania należy przesyłać drogą elektroniczną pod adres: jan.lyczakowski@uj.edu.pl z dopiskiem w tytule maila OPUS24 stypendysta 1. Zgłoszenie powinno zawierać (w formie jednego pliku pdf):

• podanie (list motywacyjny);
• CV z uwzględnieniem dorobku naukowego, pozwalające ocenić umiejętności kandydata/kandydatki w związku z planowanymi zadaniami badawczymi;
• potwierdzenie/oświadczenie o spełnianiu wymogów formalnych wynikających z regulaminu przyznawania stypendiów.

Do dokumentu należy dołączyć oświadczenie: „Wyrażam zgodę na przetwarzanie danych osobowych zawartych w mojej ofercie pracy na potrzeby niezbędne do przeprowadzenia procesu rekrutacji prowadzonego przez Zakład Biotechnologii Roślin WBBiB UJ, zgodnie z art. 13 ust. 1 i 2 rozporządzenia (UE) 2016/679 Parlamentu i Rady z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w zakresie przetwarzania danych osobowych i swobodnego przepływu tych danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46 / WE (RODO)”.

Warunki zatrudnienia
Oferujemy możliwość pracy w aktywnym zespole badawczym zajmującym się wieloma tematami związanymi z biochemią i biologią polisacharydów. Stypendysta  będzie miał możliwość rozwoju zawodowego przez poznanie nowych technik badawczych. Stypendysta będze współautorem prac badawczych wynikających z prowadzonych przez nich badan. Przewidujemy publikacje wyników w renomowanych międzynarodowych czasopismach co pomoże w rozwoju kariery stypendysty lub stypendystki. Oferowane jest stypendium w wysokości 5 000 PLN/miesiąc dla wybranej osoby.

Rozstrzygnięcie konkursu nastąpi do dnia 30 listopada 2023.