prof. dr hab. Maria Rąpała-Kozik
stanowisko: profesor
pokoj: 4.0.26 (A103), telefon: 12 664 65 27
dr Dominika Bartnicka, asystent
pokój: 4.0.24 (A135), telefon: 12 664 65 44, e-mail: dominika.ostrowska@uj.edu.pl
dr Grażyna Braś, specjalista naukowo-techniczny
pokój: 4.0.27 (A101), telefon: 12 664 65 24,e-mail: grazyna.cholewa@uj.edu.pl
dr Justyna Karkowska-Kuleta, adiunkt
pokój: 4.0.27 (A101), telefon: 12 664 65 24, e-mail: justyna.karkowska@uj.edu.pl
dr Dorota Satała, adiunkt
pokój: 4.0.27 (A101), telefon: 12 664 65 24, e-mail: dorota.satala@uj.edu.pl
dr Marcin Zawrotniak, adiunkt
pokój: 4.0.24 (A135), telefon: 12 664 65 44, e-mail: marcin.zawrotniak@uj.edu.pl
mgr Magdalena Smolarz
mgr Magdalena Surowiec
mgr Miriam Gozalez-Gonzalez
- Rola proteaz aspartylowych produkowanych przez drożdżaki z rodzaju Candida w infekcjach grzybiczych
- Adaptacja genetyczna drożdżaków do zmiennych warunków w miejscu infekcji
- Procesy adhezji i inwazji drożdżaków w odniesieniu do wybranych typów komórek gospodarza
- Mechanizmy wykorzystywane przez komórki obronne organizmu ludzkiego (np. neutrofilowe zewnątrzkomórkowe pułapki – NET) w odpowiedzi na infekcje grzybicze
-
Wpływ czynników patogennych na mechanizm formowania neutrofilowych pułapek zewnątrzkomórkowych (NET)
- Interakcje drożdżaków w obrębie mieszanych biofilmów z udziałem bakteryjnych oportunistycznych patogenów
- Biochemia witamin i koenzymów
- Techniki rozdziału związków biologicznych przy udziale różnych typów chromatografii cieczowej w układach średnio- (FPLC) i wysoko-ciśnieniowych (HPLC). W dyspozycji Zakładu znajdują się zestawy chromatograficzne firm Pharmacia, BioRad (FPLC) oraz firm: Dionex, Knauer, Shimadzu i Waters (HPLC) z detekcją spektrofotometryczną, fluorescencyjną i z użyciem spektrometrii masowej (HCT Ultra, Bruker, ze źródłem jonów typu ESI i analizatorem w postaci pułapki jonowej)
- Techniki elektroforetyczne dla analizy białek i peptydów
- Techniki biologii molekularnej: oznaczanie poziomu ekspresji genów, przygotowywanie konstruktów plazmidowych oraz produkcja białek rekombinowanych w układach bakteryjnych (Escherichia coli) oraz drożdżowych (Pichia pastoris)
- Metody badania oddziaływań międzycząsteczkowych przy użyciu powierzchniowego rezonansu plazmonów (system BIACORE 3000) oraz anizotropii fluorescencji (spektrofluorymetr Hitachi)
- Mikroskopia fluorescencyjna – zmotoryzowany mikroskop fluorescencyjny Olympus IX73
- Maria Rapała-Kozik: Grzyby z rodzaju Candida w zachłystowym zapaleniu płuc – przypadkowi towarzysze czy twórcy środowiska dla bakteryjnego patogenu beztlenowego (2020–2023) OPUS 17, NCN
- Justyna Karkowska-Kuleta: Wpływ grzybiczych pęcherzyków zewnątrzkomórkowych na formowanie i stabilność wielogatunkowych biofilmów tworzonych przez chorobotwórcze grzyby z rodzaju Candida (2019–2020). MINIATURA 3, NCN
- Marcin Zawrotniak: Rola zewnątrzkomórkowego DNA neutrofilowego jako czynnik aktywujący mechanizm uwalniania Neutrofilowych Pułapek Zewnątrzkomórkowych (2019–2020). MINIATURA 2, NCN
- Bartnicka, D., Gonzalez-Gonzalez, M., Sykut, J., Koziel, J., Ciaston, I., Adamowicz, K., Bras, G., Zawrotniak, M., Karkowska-Kuleta, J., Satala, D., Kozik, A., Zyla, E., Gawron, K., Lazarz-Bartyzel, K., Chomyszyn-Gajewska, M., & Rapala-Kozik, M. (2020). Candida albicans shields the periodontal killer Porphyromonas gingivalis from recognition by the host immune system and supports the bacterial infection of gingival tissue. International journal of molecular sciences, 21(6), 1984.
- Karkowska-Kuleta, J., Kulig, K., Karnas, E., Zuba-Surma, E., Woznicka, O., Pyza, E., Kuleta, P., Osyczka, A., Rapala-Kozik, M., & Kozik, A. (2020). Characteristics of extracellular vesicles released by the pathogenic yeast-like fungi Candida glabrata, Candida parapsilosis and Candida tropicalis. Cells, 9(7), 1722.
- Karkowska-Kuleta, J., Surowiec, M., Gogol, M., Koziel, J., Potempa, B., Potempa, J., Kozik, A., & Rapala-Kozik, M. (2020). Peptidylarginine deiminase of Porphyromonas gingivalis modulates the interactions between Candida albicans biofilm and human plasminogen and high-molecular-mass kininogen. International journal of molecular sciences, 21(7), 2495.
- Satala, D., Karkowska-Kuleta, J., Zelazna, A., Rapala-Kozik, M., & Kozik, A. (2020). Moonlighting proteins at the candidal cell surface. Microorganisms, 8(7), 1046.
- Guevara-Lora, I., Bras, G., Karkowska-Kuleta, J., González-González, M., Ceballos, K., Sidlo, W., & Rapala-Kozik, M. (2020). Plant-derived substances in the fight against infections caused by Candida Species. International journal of molecular sciences, 21(17), 6131.
- Zawrotniak, M., Wojtalik, K., & Rapala-Kozik, M. (2019). Farnesol, a quorum-sensing molecule of Candida albicans triggers the release of neutrophil extracellular traps. Cells, 8(12), 1611.
- Zawrotniak, M., Bartnicka, D., & Rapala-Kozik, M. (2019). UVA and UVB radiation induce the formation of neutrophil extracellular traps by human polymorphonuclear cells. Journal of photochemistry and photobiology. B, Biology, 196, 111511.
- Bartnicka, D., Karkowska-Kuleta, J., Zawrotniak, M., Satała, D., Michalik, K., Zielinska, G., Bochenska, O., Kozik, A., Ciaston, I., Koziel, J., Dutton, L. C., Nobbs, A. H., Potempa, B., Baster, Z., Rajfur, Z., Potempa, J., & Rapala-Kozik, M. (2019). Adhesive protein-mediated cross-talk between Candida albicans and Porphyromonas gingivalis in dual species biofilm protects the anaerobic bacterium in unfavorable oxic environment. Scientific reports, 9(1), 4376.
- Karkowska-Kuleta, J., Satala, D., Bochenska, O., Rapala-Kozik, M,, & Kozik, A. Moonlighting proteins are variably exposed at the cell surfaces of Candida glabrata, Candida parapsilosis and Candida tropicalis under certain growth conditions. BMC Microbiol. 2019 Jul 3;19(1):149.
- Karkowska-Kuleta, J., Bartnicka, D., Zawrotniak, M., Zielinska, G., Kieronska, A., Bochenska, O., Ciaston, I., Koziel, J., Potempa, J., Baster, Z., Rajfur, Z., & Rapala-Kozik, M. The activity of bacterial peptidylarginine deiminase is important during formation of dual-species biofilm by periodontal pathogen Porphyromonas gingivalis and opportunistic fungus Candida albicans. Pathog Dis. 2018 Jun 1;76(4):fty033
- Zawrotniak, M., Bochenska, O., Karkowska-Kuleta, J., Seweryn-Ozog, K., Aoki, W., Ueda, M., Kozik, A., & Rapala-Kozik, M. (2017). Aspartic Proteases and Major Cell Wall Components in Candida albicans Trigger the Release of Neutrophil Extracellular Traps. Frontiers in cellular and infection microbiology, 7, 414.
- Wpływ czynników wirulencji drożdżaków Candida albicans na odpowiedź fibroblastów dziąsłowych
- Konsekwencje degradacji kluczowych białek gospodarza przez drożdżowe proteazy aspartylowe i ich wpływ na funkcjonalność badanych białek
- Generacja zewnątrzkomórkowych sieci DNA (NET) przez wybrane komórki układu odpornościowego pod wpływem kontaktu z komórkami C. albicans oraz ich izolowanymi czynnikami wirulencji
- Zmiany ekspresja genów wybranych czynników wirulencji C. albicans w kontakcie z komórkami gospodarza
- Zmiana ekspresji wybranych genów komórek obronnych w kontakcie z C. albicans
- Możliwość tworzenia mieszanych biofilmów C. albicans i patogennych bakterii – analiza czynników zaangażowanych w procesy adhezji obu typów mikroorganizmów
- Identyfikacja oddziaływania potencjalnych adhezyn C. albicans z białkami gospodarza metodą SPR (surface plasmon resonance)
- Strukturalna charakterystyka enzymów biosyntezy tiaminy z zastosowaniem ukierunkowanej mutagenezy.
Zainteresowanie pracą eksperymentalną w zakresie biochemii, inżynierii genetycznej i fizykochemii. Zapał i entuzjazm w pracy badawczej oraz umiejętność poszukiwania nowych rozwiązań.